BIOINFORMATICA
| A.A. | CFU |
|---|---|
| 2006/2007 | 8 |
| Docente | Ricevimento studentesse e studenti | |
|---|---|---|
| Alessandro Bogliolo |
Assegnato al Corso di Studio
| Giorno | Orario | Aula |
|---|
Programma
01. Introduzione
01.01 Confronto tra sistemi di calcolo e sistemi biologici
01.02 Biologia computazionale
01.03 Sistemi di elaborazione ispirati alla biologia
01.04 Esempi
02. Basi teoriche
02.01 Teoria dell'informazione
02.02 Teoria della probabilit?
02.03 Algoritmi
03. Allineamento di sequenze
03.01 Formulazione del problema
03.02 Verosimiglianza e punteggi
03.03 Caratterizzazione delle matrici di sostituzione
03.04 Distanza di edit e similarit?
03.05 Programmazione dinamica
03.06 Algoritmi di allineamento esatti
03.07 Algoritmi di allineamento euristici
04. Allineamento multiplo
04.01 Formulazione del problema
04.02 Significato strutturale
04.03 Significato filogenetico
04.04 Algoritmi
05. Sequenziamento di biomolecole
05.01 Formulazione del problema
05.02 Sequenziamento di frammenti
05.03 Decodifica di elettroferogrammi
05.04 Qualit? delle basi
05.05 Sequenziamento del genoma
05.06 Assemblaggio di frammenti
06. Progetto di primer
06.01 Formulazione del problema
06.02 Primer per sequenziamento
06.03 Primer per PCR
07. Analisi di microarray
07.01 Struttura di un microarray
07.02 Acquisizione dati
07.03 Elaborazione delle immagini
07.04 Analisi dei dati: scatterplot, classificazione, clustering
08. Laboratorio
08.01 Introduzione all'uso di strumenti bioinformatici
08.02 Uso di BioEdit per l'allineamento di sequenze
08.03 Uso di Oligo per il progetto di primer
08.04 Uso di GenePix per l'analisi di microarray
Modalità Didattiche, Obblighi, Testi di Studio e Modalità di Accertamento
- Modalità didattiche
- Lezione frontale
- Modalità di
accertamento - Esame orale
- Disabilità e DSA
Le studentesse e gli studenti che hanno registrato la certificazione di disabilità o la certificazione di DSA presso l'Ufficio Inclusione e diritto allo studio, possono chiedere di utilizzare le mappe concettuali (per parole chiave) durante la prova di esame.
A tal fine, è necessario inviare le mappe, due settimane prima dell’appello di esame, alla o al docente del corso, che ne verificherà la coerenza con le indicazioni delle linee guida di ateneo e potrà chiederne la modifica.
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