Programma
Enzimi per il clonaggio del DNA
Nucleasi, Fosfomonoesterasi, Polinucleotide chinasi, DNA ligasi, DNA polimerasi, DNA polimerasi RNA dipendente (trascrittasi inversa), Deossinucleotidil trasferasi, PoliA polimerasi, Enzimi di restrizione
Sistemi biologici della biotecnologia molecolare
Escherichia coli, Saccharomyces cerevisiae
Le colture cellulari eucariotiche
Biologia di base dei vettori plasmidici e fagici
Caratteristiche essenziali dei plasmidi
Caratteristiche desiderate dei plasmidi come vettori di clonaggio
Caratteristiche essenziali del batteriofago lambda
Organizzazione del DNA nei vettori lambda
Vettori lambda avanzati
Cosmidi, fasmidi ed altri vettori avanzati
Vettori cosmidici
Vettori BAC e PAC
Vettori per clonaggio in S. cerevisiae (plasmidici, YAC e vettori ARS)
Vettori derivanti da SV40
La trasformazione genetica dei procarioti
Il trasferimento di DNA in E. coli
Elettroporazione
Metodi di selezione
Trasferimento genico nelle piante
Trasformazione mediata da Agrobacterium
Plasmidi Ti
Altri metodi di trasformazione e metodi di ricerca
Creazione di genoteche di DNA genomico e cDNA
Preparazione del DNA genomico e di cDNA per la generazione di genoteche
La PCR come alternativa al clonaggio
Strategie di analisi delle genoteche
Clonaggio differenziale
Tecniche di base della tecnologia del DNA ricombinante
Elettroforesi in gel d?agarosio
Trasferimento di acidi nucleici su membrana (Southern blot, Northern blot)
Ibridazione di acidi nucleici trasferiti su membrana e tecniche di marcatura del DNA
Autoradiografia
Reazione a catena della polimerasi (RT-PCR, LA-PCR, RACE-PCR, PCR inversa, PCR quantitativa in tempo reale)
Sequenziamento e mutagenesi
Attivit? di laboratorio
Le esercitazioni di laboratorio riguarderanno l?acquisizione delle strategie di base volte alla clonazione di un gene d?interesse a partire da RNA messaggero.
1. Isolamento di RNA in condizioni denaturanti da diversi tessuti di partenza
2. Analisi elettroforetica e spettrofotometrica dell?RNA estratto
3. Sintesi di cDNA dall?RNA isolato, tramite RT PCR
4. PCR con primers degenerati
5. PCR nested
6. Ligasi dei prodotti amplificati in vettori plasmidici
7. Trasformazione dei vettori ricombinanti in E.coli e screening dei cloni ottenuti
Una seconda parte dell?attivit? di laboratorio riguarder? l?applicazione di metodi per la ricerca di organismi geneticamente modificati (OGM) in matrici di origine vegetali e in prodotti per l?alimentazione umana e vegetale
1. Isolamento di DNA dai prodotti in esame
2. PCR dell?elemento genetico NOS
3. Visualizzazione dei prodotti di PCR tramite elettroforesi ed interpretazione dei risultati
4. Quantificazione degli OGM tramite PCR in tempo reale