DATA-SCIENCE AND MULTI-OMICS ANALYSIS (MOD. 1: FUNDAMENTALS OF BIOINFORMATICS)
DATA-SCIENCE AND MULTI-OMICS ANALYSIS (MOD. 1: FUNDAMENTALS OF BIOINFORMATICS)
A.A. | CFU |
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2024/2025 | 3 |
Docente | Ricevimento studentesse e studenti | |
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Annamaria Ruzzo | contattare il docente per email |
Didattica in lingue straniere |
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Insegnamento interamente in lingua straniera
Inglese
La didattica è svolta interamente in lingua straniera e l'esame può essere sostenuto in lingua straniera. |
Assegnato al Corso di Studio
Giorno | Orario | Aula |
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Giorno | Orario | Aula |
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Obiettivi Formativi
Si tratta di un breve corso per fornire le informazioni di base e gli strumenti che sono alla base e comunemente utilizzati per problemi più classici della bioinformatica, come la consultazione di banche dati, allineamenti e multi allineamenti
Programma
Concetti e principi di bioinformatica, matrici di similarità (matrici PAM e BLOSUM), penalizzazione di inserzioni e delezioni nell'allineamento, algoritmi di allineamento (Dot plot, Needleman-Wunsch, Smith-waterman), allineamenti multipli (clustal W), ricerca nelle banche dati con metodi euristici (FASTA e la famiglia BLAST). Ricerca con il metodo del profilo nelle banche dati (esempio PSI-BLAST).
Risultati di Apprendimento (Descrittori di Dublino)
Gli studenti acquisiranno le seguenti competenze:
1- apprendere e discutere gli argomenti trattati in classe
2- dimostrare di essere in grado di risolvere semplici problemi a partire da dati biologici reperiti nelle principali banche dati biologiche.
Materiale Didattico
Il materiale didattico predisposto dalla/dal docente in aggiunta ai testi consigliati (come ad esempio diapositive, dispense, esercizi, bibliografia) e le comunicazioni della/del docente specifiche per l'insegnamento sono reperibili all'interno della piattaforma Moodle › blended.uniurb.it
Attività di Supporto
Il materiale didattico preparato dal docente oltre ai libri di testo consigliati (come ad esempio slides, appunti delle lezioni, esercizi, bibliografia) e le comunicazioni del docente specifiche del corso
si trovano all'interno della piattaforma Moodle: blended.uniurb.ii
Modalità Didattiche, Obblighi, Testi di Studio e Modalità di Accertamento
- Modalità didattiche
Didattica frontale ed esempi pratici utilizzando il laptop
- Didattica innovativa
imparare facendo
- Testi di studio
Per approfondire: Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins
A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins: Andreas D. Baxevanis , Gary Bader, David Wishart
Editor: BLACKWELL PUBL
« torna indietro | Ultimo aggiornamento: 14/01/2025 |