Obiettivi Formativi
Scopo del corso è fornire agli studenti conoscenze sulle basi molecolari dei processi genetici fondamentali e principi teorici per comprendere ed applicare alcune delle metodologie di indagine molecolare utilizzate per isolare, caratterizzare i geni e valutarne l’espressione.Pertanto saranno considerati obiettivi formativi qualificanti:
· il raggiungimento di una conoscenza approfondita e integrata della struttura e funzione dei geni, con particolare riferimento ai meccanismi molecolari che ne regolano l'espressione, sia nei procarioti sia negli eucarioti;
· l'acquisizione di conoscenze teoriche e competenze pratiche relativamente ad alcune delle principali tecniche di manipolazione e analisi degli acidi nucleici.
Programma
Acidi nucleici: DNA e RNA
Identificazione del DNA come materiale genetico.
Chimica degli acidi nucleici.
Struttura primaria, secondaria, terziaria e relative propriet?.
Replicazione del DNA
Caratteristiche ed enzimologia della replicazione del DNA.
Replicazione di: genoma batterico, DNA mitocondriale, genomi virali, genoma delle cellule eucariotiche.
Danni al DNA e meccanismi di riparo
Possibili cause di danno al DNA: agenti endogeni ed esogeni.
Riparazione tramite: inversione diretta del danno, escissione, ricombinazione.
Riparazione degli appaiamenti errati e delle rotture della doppia elica.
Accoppiamento fra trascrizione e riparazione.
Riarrangiamenti del DNA
Ricombinazione omologa, ricombinazione sito-specifica, trasposizione: meccanismi molecolari.
Sintesi di RNA da stampi di DNA: trascrizione
Trascrizione nei procarioti.
Modello dell'operon: controllo positivo e negativo della trascrizione, attenuazione trascrizionale.
Trascrizione negli eucarioti: RNA polimerasi e relativi promotori e fattori di trascrizione.
Maturazione dell'RNA: splicing, capping, poliadenilazione, editing.
Meccanismi di degradazione dell'RNA.
Dall'RNA alle proteine: traduzione
Codice genetico, mRNA, tRNA, ribosomi.
Traduzione nei procarioti.
Traduzione negli eucarioti: modificazioni post-traduzionali e smistamento delle proteine neosintetizzate.
Chaperon molecolari e folding delle proteine.
Struttura e funzionamento dei geni negli eucarioti superiori
Struttura della cromatina, introni.
Regolazione dell'espressione genica:
? controllo genomico: alterazioni selettive del DNA, decondensazione della cromatina, modificazioni covalenti degli istoni.
? controllo trascrizionale: enhancer, silencer, elementi di risposta nel DNA, fattori di trascrizione gene-specifici e loro regolazione.
? controllo post-trascrizionale: maturazione, esportazione dal nucleo e stabilit? dell'RNA messaggero.
? controllo traduzionale e post-traduzionale.
Strategie di modulazione dell'espressione genica: antisenso; decoy; RNA interference.
Tecnologia del DNA ricombinante
Clonaggio del DNA: enzimi, vettori, cellule ospiti.
Principali strategie di identificazione e analisi del DNA ricombinante.
Transfezione in cellule eucariotiche.
Tecniche di analisi dell'espressione genica
Ibridazione in situ; northern blotting; RT-PCR, RNase protection assay; microarrays.